Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GscQ02591 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GscQ02591 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GscQ02591 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GscQ02591 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GscQ02591 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms