Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh1Q02576 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms