Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnnb1Q02248 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms