Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdcd1Q02242 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcd1Q02242 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms