Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms