Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1cQ01815 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1cQ01815 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms