Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gja5Q01231 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja5Q01231 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms