Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col1a2Q01149 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms