Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms