Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb2Q00977 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms