Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms