Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab33aP97950 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms