Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlkP97793 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlkP97793 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlkP97793 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlkP97793 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlkP97793 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AlkP97793 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AlkP97793 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AlkP97793 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AlkP97793 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AlkP97793 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AlkP97793 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlkP97793 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms