Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra1P97785 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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