Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms