Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp1P97350 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms