Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx1P83917 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx1P83917 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms