Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbx1P82976 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx1P82976 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms