Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms