Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr4P70658 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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