Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rit1P70426 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms