Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra8P70278 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stra8P70278 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra8P70278 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra8P70278 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms