Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms