Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hoxd13P70217 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hoxd13P70217 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hoxd13P70217 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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