Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms