Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tra2bP62996 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms