Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsnl1P62761 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms