Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm3P62311 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms