Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Depdc5P61460 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Depdc5P61460 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms