Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms