Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms