Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CdaP56389 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CdaP56389 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CdaP56389 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CdaP56389 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CdaP56389 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CdaP56389 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms