Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1P56183 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms