Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp1P55194 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms