Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms