Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aqp4P55088 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms