Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ephb3P54754 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ephb3P54754 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms