Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms