Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms