Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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