Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lbx1P52955 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lbx1P52955 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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