Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms