Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms