Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec1P51908 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms