Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Defa6P50704 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms