Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms