Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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