Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbp3P49194 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms