Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms