Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prox1P48437 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms